Πρόσκαιρη κατοχή είχε ο Robert Guiscard, ο Roger II ο Σικελός, ο Μαργαριτώνης μέχρι που το 1195 την ηγεμονία ανέλαβε ο οίκος των Orsini για να την παραδώσει το 1357 στους Tocchi. Η μικρή χρονικά τουρκική κατοχή έληξε με την κατάκτηση της πρώτης πρωτεύουσάς της, του Κάστρου του Αγίου Γεωργίου από τους Ενετούς (και Ισπανούς) το 1500.
Η Ενετοκρατία κράτησε σχεδόν 300 χρόνια. Το 1797 οι Γάλλοι εξεδίωξαν τους Βενετούς κι ένα χρόνο μετά, οι συμμαχικοί στόλοι Ρωσίας-Τουρκίας υποδαύλισαν την επανάσταση κατά των Γάλλων και έτσι σχηματίστηκε η Επτάνησος Πολιτεία. Η σύντομη Γαλλική κατοχή που ακολούθησε (1807-1809) διακόπηκε από τους Άγγλους οι οποίοι παρέμειναν μέχρι το 1864, χρόνο ένωσης των Επτανήσων με την Ελλάδα.

Το 1940 μέχρι το 1943 οι Ιταλοί βρέθηκαν να έχουν κατακτήσει το νησί μας, και τον Σεπτέμβριο του 1943, κατά την Ιταλογερμανική σύρραξη, χιλιάδες Ιταλοί στρατιώτες της Μεραρχίας Άκουϊ σφαγιάστηκαν από τους Γερμανούς. Την ίδια περίοδο βομβαρδίστηκε το νησί από γερμανικά αεροπλάνα και υπήρξαν δεκάδες θύματα και εκτεταμένες καταστροφές κτιρίων.

Το μικρό διάστημα της Γερμανικής κατοχής ακολούθησε ο εμφύλιος.

Οι καταστροφικοί σεισμοί του Αυγούστου του 1953 άλλαξαν δραματικά την πορεία του νησιού. Η πρωτεύουσα του νησιού, και τα περισσότερα χωριά καταστράφηκαν εντελώς ενώ υπήρξαν εκατοντάδες νεκροί, τραυματίες και άστεγοι. Η μετανάστευση και η φυγή προς τη ναυτιλία ως διέξοδος στην ανεργία τα χρόνια που ακολούθησαν τον σεισμό του 1953 έφεραν, όχι μόνο την πληθυσμιακή κατάρρευση της Κεφαλλονιάς, αλλά τον οικονομικό μαρασμό, την πολιτιστική και κοινωνική απραγία.